Applications des peptides

Aujourd'hui, nous partageons une importante étude, bientôt publiée dans Nature Communications, intitulée « Identification de peptides antimicrobiens issus de microbiomes intestinaux anciens ». Cette étude, grâce au développement d'un outil d'intelligence artificielle léger nommé AMPLiT, a analysé de manière systématique les données métagénomiques de sept coprolithes (fossiles fécaux humains anciens) datant de 1000 à 2000 ans. Elle a permis d'identifier 160 candidats potentiels de peptides antimicrobiens (PAM). La validation expérimentale a montré que parmi les 40 peptides synthétisés avec succès, 36 (90 %) présentaient une activité antibactérienne significative in vitro. Fait remarquable, environ deux tiers des peptides antimicrobiens actifs provenaient de Segatella copri (anciennement Prevotella copri), une bactérie symbiotique dominante des intestins anciens dont la prévalence a considérablement diminué dans les populations modernes. Ces peptides antimicrobiens issus de microbiomes anciens possèdent non seulement des mécanismes de perturbation membranaire, une faible cytotoxicité et un faible risque d'hémolyse, mais ont également démontré une efficacité comparable à celle des antibiotiques classiques (vancomycine, polymyxine B) dans un modèle murin d'infection de plaie. Ces travaux révèlent l'immense potentiel des microbiomes intestinaux anciens comme source inépuisable de nouveaux peptides antimicrobiens, offrant ainsi une solution novatrice pour lutter contre la crise de la résistance aux antibiotiques.