Synthèse peptidique

Aujourd'hui, nous partageons un article de recherche publié dans Nature Communications par l'équipe d'Ewa Szczurek. Cette étude a développé HydrAMP, un modèle génératif profond, un auto-encodeur variationnel conditionnel (cVAE) qui génère de nouveaux peptides antimicrobiens (AMP) à forte activité antimicrobienne en apprenant des représentations continues de faible dimension des peptides. Ce travail est le premier à permettre la génération contrôlée d'analogues de peptides actifs/inactifs connus, les effets antibactériens exceptionnels des peptides générés ayant été validés par des expériences en laboratoire. Il offre un outil de conception informatique puissant pour lutter contre la crise mondiale de la résistance aux antimicrobiens.

Aujourd'hui, nous partageons un article de recherche dirigé par l'équipe de Monika Raj et publié dans Organic Letters. Cette étude a permis de développer une méthode chimiosélective, catalysée par un acide, qui convertit efficacement le groupe guanidino de l'arginine des peptides en une structure aminopyrimidine grâce au malonaldehyde (MDA). Cette stratégie permet non seulement une conversion quasi quantitative et une excellente chimiosélectivité, mais aussi une modification ultérieure en fin de synthèse pour construire des sels d'imidazo[1,2-a]pyrimidinium, améliorant ainsi significativement la perméabilité membranaire des peptides. Elle offre une nouvelle plateforme pour élargir le champ des possibles en matière de médicaments peptidiques.

Nous partageons aujourd'hui un article de recherche dirigé par l'équipe du professeur Gong Hegui et publié dans le Journal of the American Chemical Society. Cette étude a développé, pour la première fois, une stratégie de couplage croisé réducteur catalysée par le nickel permettant la vinylation et l'arylation stéréodivergentes, contrôlées par ligand, du carbone α interne des chaînes peptidiques. En utilisant des unités d'α-tosylglycine (TsG) racémiques, facilement disponibles, comme électrophiles clés, ces travaux surmontent la difficulté de stéréocontrôle rencontrée dans la modification peptidique traditionnelle, offrant ainsi un nouvel outil puissant pour la fonctionnalisation précise en fin de synthèse des peptides thérapeutiques.

Nous partageons aujourd'hui un article de recherche dirigé par l'équipe du professeur Ping Wang et publié dans le Journal of the American Chemical Society. Cette étude présente une nouvelle plateforme de synthèse peptidique en phase solide (SPPS) basée sur la chimie Fmoc/pyridinylméthyle (Fmoc/Pic). Utilisant le clivage photocatalytique sous lumière visible des liaisons CX (X = O, N, S), cette plateforme permet une déprotection efficace et orthogonale des chaînes latérales d'acides aminés dans des conditions douces et sans acide trifluoroacétique (TFA), offrant ainsi une solution révolutionnaire pour la synthèse durable et efficace de peptides thérapeutiques.

Aujourd'hui, nous partageons un article de recherche dirigé par le professeur Hugh Nakamura de l'Université des sciences et technologies de Hong Kong (HKUST), publié dans Angewandte Chemie International Edition. Cette étude a permis de développer une stratégie de synthèse efficace intégrant un couplage croisé électrophile catalysé par le nickel et assisté électrochimiquement, associé à une macrocyclisation de Larock régiosélective. Cette stratégie a permis la construction réussie de la liaison biaryle tyrosine C6–tryptophane C5′ (Tyr C6–Trp C5′) fortement contrainte et la synthèse totale du micitide 982, un peptide synthétisé par les ribosomes et modifié post-traductionnellement (RiPP). Ces travaux offrent une approche modulaire et généralisable pour la synthèse de peptides cycliques complexes analogues.

Cet article vise à analyser le développement des technologies de synthèse peptidique en phase solide (SPPS), en présentant une revue ciblée de son origine, de ses principes fondamentaux, de ses aspects techniques clés, des défis actuels et des perspectives d'avenir. Il a pour objectif de fournir une référence technique complète et approfondie aux chercheurs et aux praticiens du domaine.

À ce jour, les chercheurs ont conçu et développé plus d'une centaine de réactifs de couplage amide de structures diverses, contribuant ainsi de manière significative au développement de la synthèse peptidique. Cet article présente une synthèse de plusieurs réactifs de couplage couramment utilisés en synthèse peptidique.

Introduction à la synthèse en phase solide Fmoc

La synthèse en phase solide Fmoc a été initiée par Eric Atherton et Bob Sheppard à l'Université de Cambridge à la fin des années 1970 (et systématiquement perfectionnée par Chan et White). Sa méthodologie de base utilise le groupe Fmoc (9-fluorénylméthoxycarbonyle) comme ligand. Groupe protecteur α-amino pour les acides aminés.