પેપ્ટાઇડ સંશ્લેષણ

આજે, અમે ટોક્યો યુનિવર્સિટીના પ્રોફેસર હિરોઆકી સુગાની ટીમ દ્વારા "ટોપોલોજિકલ રીતે વ્યાખ્યાયિત થિયોઇસોઇન્ડોલ-બ્રિજ્ડ સાયકલિક પેપ્ટાઇડ્સનું રિબોસોમલ સિન્થેસિસ" શીર્ષક સાથે એન્જેવાન્ડે કેમીમાં પ્રકાશિત થયેલા મહત્વપૂર્ણ સંશોધનને શેર કરીએ છીએ. આ અભ્યાસમાં થિયોઇસોઇન્ડોલ બ્રિજિંગ પર આધારિત સાયકલિક પેપ્ટાઇડ્સ માટે એક નવીન કૃત્રિમ વ્યૂહરચના વિકસાવવામાં આવી હતી. અનુવાદ આરંભ કરનાર તરીકે સેમીકાર્બાઝોન-પ્રોટેક્ટેડ 2-નિકોટીનોલબેન્ઝાલ્ડિહાઇડ એમિનો એસિડ (Ac-Ala(NtBA)Sc-CME) ડિઝાઇન કરીને, તેને લવચીક ઇન વિટ્રોટ્રાન્સલેશન (FIT) સિસ્ટમનો ઉપયોગ કરીને પેપ્ટાઇડ સાંકળોમાં કાર્યક્ષમ રીતે સમાવિષ્ટ કરવામાં આવ્યું હતું. ત્યારબાદ, હળવા એસિડ ટ્રીટમેન્ટથી ઇન્ટ્રામોલેક્યુલર સાયકલાઈઝેશન પ્રતિક્રિયા શરૂ થઈ, માળખાકીય રીતે ચોક્કસ સાયકલિક પેપ્ટાઇડ્સનું સફળતાપૂર્વક નિર્માણ થયું. આ પદ્ધતિ mRNA ડિસ્પ્લે ટેકનોલોજી સાથે સંપૂર્ણપણે સુસંગત છે, જે દવાની શોધ માટે મોટા પાયે, ટોપોલોજીકલ રીતે વ્યાખ્યાયિત સાયકલિક પેપ્ટાઇડ લાઇબ્રેરીઓ બનાવવા માટે એક શક્તિશાળી પ્લેટફોર્મ પૂરું પાડે છે.

આજે આપણે ચીની વૈજ્ઞાનિક ટીમ દ્વારા સાયન્સ એડવાન્સિસમાં પ્રકાશિત થયેલા મહત્વપૂર્ણ સંશોધન તારણો શેર કરીએ છીએ. આ અભ્યાસ મોડ્યુલર 1,3,5-ટ્રાયઝિન સ્કેફોલ્ડ - ટ્રાયઝિન-પાયરિડિનિયમ કેમિસ્ટ્રી (TPC) પર આધારિત એક નવી સિસ્ટીન (Cys)-પસંદગીયુક્ત બાયોકંજ્યુગેશન ટેકનોલોજીનો અહેવાલ આપે છે. આ કાર્ય એન્ટિબોડી-ડ્રગ કન્જુગેટ્સ (ADCs) જેવા ઉપચારાત્મક એપ્લિકેશનોમાં ઉચ્ચ સ્થિરતા સાથે Cys-પસંદગીયુક્ત રીએજન્ટ્સની મહત્વપૂર્ણ જરૂરિયાતને સંબોધે છે. વ્યવસ્થિત માળખાકીય ફેરફારો અને ગણતરીત્મક અભ્યાસો દ્વારા, ટીમે એક રીએજન્ટને ઑપ્ટિમાઇઝ કર્યું જે શારીરિક પરિસ્થિતિઓ (pH 7.4) હેઠળ Cys (>95% ઉપજ) ના નજીકના-માત્રાત્મક લેબલિંગ પ્રાપ્ત કરવા સક્ષમ છે, જ્યારે ટાયરોસિન (Tyr) પ્રત્યે પ્રતિક્રિયાશીલતાને અસરકારક રીતે દબાવીને, પ્રારંભિક TPC પ્રોબ્સની મર્યાદાઓને દૂર કરે છે. અભ્યાસમાં ઉપચારાત્મક એન્ટિબોડી ટ્રાસ્ટુઝુમાબ સહિત વિવિધ પેપ્ટાઇડ્સ અને પ્રોટીન સાથે તેની સારી સુસંગતતા દર્શાવવામાં આવી હતી, અને ADCs બનાવવામાં તેની સંભાવના દર્શાવવામાં આવી હતી. ઑપ્ટિમાઇઝ્ડ લેબલિંગ પદ્ધતિ જૈવિક વાતાવરણમાં સંયોજકોની ઉત્તમ સ્થિરતા સુનિશ્ચિત કરે છે, જે આ અભિગમના વ્યવહારુ ઉપયોગ મૂલ્યને પ્રકાશિત કરે છે.

આજે, અમે જાપાનના ચુબુ યુનિવર્સિટી ખાતે પેપ્ટાઇડ સાયન્સ સેન્ટરના ટોમોહિરો હાટ્ટોરી અને હિસાશી યામામોટોની ટીમ દ્વારા ઓર્ગેનિક પ્રોસેસ રિસર્ચ એન્ડ ડેવલપમેન્ટમાં પ્રકાશિત એક મહત્વપૂર્ણ સંશોધન લેખ શેર કરીએ છીએ. પરંપરાગત પેપ્ટાઇડ સંશ્લેષણમાં લાંબા સમયથી ચાલતા પડકારો જેમ કે વધુ પડતા ઉમેરણનો ઉપયોગ, ઉપ-ઉત્પાદન ઉત્પાદન અને પ્રક્રિયા જટિલતાને સંબોધતા, આ અભ્યાસે પેન્ટાફ્લોરોફેનાઇલ (Pfp) એસ્ટર પર આધારિત એક નવીન પ્રવાહ રસાયણશાસ્ત્ર સંશ્લેષણ વ્યૂહરચના વિકસાવી છે. આ પદ્ધતિનો મુખ્ય હેતુ Pfp એસ્ટર્સની ઉચ્ચ પ્રતિક્રિયાશીલતા અને સ્થિરતાનો ઉપયોગ કરીને સ્ટોઇકિયોમેટ્રિક એમિનો એસિડ એસ્ટર સાથે કાર્યક્ષમ, ઝડપી ઘનીકરણ પ્રાપ્ત કરવામાં રહેલો છે - જેમાં અત્યંત પડકારજનક N-મિથાઇલ એમિનો એસિડ એસ્ટરનો સમાવેશ થાય છે - કોઈપણ ઉમેરણોની જરૂર વગર. સંશોધને ઓનલાઈન ડિપ્રોટેક્શન માટે DBU પોલિમર સાથે સંકલિત સતત પ્રવાહ પ્રણાલીની સ્થાપના કરી, જે ડાયપેપ્ટાઇડ્સથી પેન્ટાપેપ્ટાઇડ્સ (લ્યુ-એન્કેફાલિન અને થાઇમોપેન્ટિન જેવા બાયોએક્ટિવ સિક્વન્સ સહિત) સુધીના ક્રમિક એસેમ્બલીને સફળતાપૂર્વક પૂર્ણ કરે છે. ઉત્પાદનો ઉચ્ચ શુદ્ધતા સાથે મેળવવામાં આવ્યા હતા, અને સિસ્ટમ ગ્રામ સ્કેલ પર સ્વચાલિત, લાંબા-અવધિ સંશ્લેષણને સક્ષમ કરે છે. આ કાર્ય પેપ્ટાઇડ ફાર્માસ્યુટિકલ્સ માટે ગ્રીન, કાર્યક્ષમ અને સ્કેલેબલ ઉત્પાદન પ્રક્રિયાઓ વિકસાવવા માટે એક તદ્દન નવો ઉકેલ પૂરો પાડે છે.

આજે, અમે ઓર્ગેનિક લેટર્સમાં પ્રકાશિત લિન ડોંગની આગેવાની હેઠળની ટીમનો એક મહત્વપૂર્ણ સંશોધન લેખ શેર કરીએ છીએ. આ કાર્ય પેપ્ટાઇડ દવા ટિર્ઝેપેટાઇડ (ટાઇપ 2 ડાયાબિટીસ અને સ્થૂળતાની સારવાર માટે એક નવલકથા ડ્યુઅલ-ટાર્ગેટ એગોનિસ્ટ) માટે સોલિડ-ફેઝ પેપ્ટાઇડ સિન્થેસિસ (SPPS) માં ઊંચી કિંમત અને બોજારૂપ પ્રક્રિયાઓની અવરોધોને સંબોધિત કરે છે, જે એક નવી હાઇડ્રોફોબિક ટેગ-સહાયિત પ્રવાહી-તબક્કો પેપ્ટાઇડ સિન્થેસિસ (LPPS) વ્યૂહરચના વિકસાવીને છે. આ પદ્ધતિ દ્રાવ્ય હાઇડ્રોફોબિક ટૅગ્સ (TAGa અને TAGb) રજૂ કરે છે, કાર્યક્ષમ વિભાજન પ્રાપ્ત કરવા માટે તેમના અનન્ય દ્રાવ્યતા ગુણધર્મોનો ઉપયોગ કરે છે, એમિનો એસિડ અને દ્રાવક કચરાને નોંધપાત્ર રીતે ઘટાડે છે. તે સાઇડ-ચેઇન એસેમ્બલીને ચોક્કસ રીતે નિયંત્રિત કરવા માટે લાયસિન પર ડ્યુઅલ-પ્રોટેક્શન (Cbz/Fmoc) વ્યૂહરચનાનો પણ ઉપયોગ કરે છે, આખરે ઉચ્ચ ઉપજ સાથે 39-એમિનો-એસિડ ટિર્ઝેપેટાઇડનું સફળતાપૂર્વક સંશ્લેષણ કરે છે. આ કાર્ય જટિલ પેપ્ટાઇડ દવાઓના લીલા અને આર્થિક મોટા પાયે ઉત્પાદન માટે એક નવો અભિગમ પૂરો પાડે છે.

આજે, અમે તમારી સાથે લેન્ઝોઉ યુનિવર્સિટીના ઝિન્ઝિયાંગ લેઈના નેતૃત્વ હેઠળની ટીમ દ્વારા કરવામાં આવેલા મહત્વપૂર્ણ સંશોધનને શેર કરીએ છીએ, જે એન્જેવાન્ડે કેમી ઇન્ટરનેશનલ એડિશનમાં પ્રકાશિત થયું છે. આ કાર્ય અસુરક્ષિત પેપ્ટાઇડ્સના કાર્યક્ષમ સાયકલાઇઝેશન માટે થિયોલ-એન ફોટોક્લિક રસાયણશાસ્ત્રનો પ્રથમ ઉપયોગ દર્શાવે છે, જે ઝડપી, ખૂબ પસંદગીયુક્ત અને ખૂબ જ બાયોકોમ્પેટિબલ નવી પદ્ધતિ વિકસાવે છે. સંશોધકોએ સસ્તી અને સરળતાથી ઉપલબ્ધ ટ્રાઇ-એલ્કીન ક્રોસલિંકર TAIC નો ઉપયોગ કુશળતાપૂર્વક કર્યો. દૃશ્યમાન પ્રકાશ સક્રિયકરણ હેઠળ, સાયકલાઇઝેશન ફક્ત 6 મિનિટમાં પૂર્ણ થાય છે. તેઓએ આનુવંશિક રીતે એન્કોડેડ સાયકલિક પેપ્ટાઇડ લાઇબ્રેરી બનાવવા માટે ફેજ ડિસ્પ્લે ટેકનોલોજી સાથે સફળતાપૂર્વક આને સંકલિત કર્યું, મહત્વપૂર્ણ ડ્રગ લક્ષ્ય સાયક્લોફિલિન A માટે અલ્ટ્રા-હાઇ સબ-માઇક્રોમોલર એફિનેટી સાથે નવલકથા લિગાન્ડ્સ માટે સ્ક્રીનીંગ. આ અભ્યાસ પ્રતિબંધિત પેપ્ટાઇડ દવાઓની શોધ માટે એક શક્તિશાળી અને બહુમુખી નવું પ્લેટફોર્મ પૂરું પાડે છે.

આજે, અમે શાંઘાઈ જિયાઓ ટોંગ યુનિવર્સિટીના પ્રોફેસર પિંગ વાંગની ટીમ દ્વારા કરવામાં આવેલા મહત્વપૂર્ણ સંશોધનને તમારી સાથે શેર કરીએ છીએ, જે એન્જેવાન્ડે કેમી ઇન્ટરનેશનલ એડિશનમાં પ્રકાશિત થયું છે. આ અભ્યાસ પ્રોટીન રાસાયણિક સંશ્લેષણમાં સિસ્ટીન (Cys) ના પસંદગીયુક્ત રક્ષણ અને ડિપ્રોટેક્શનના મુખ્ય પડકારને સંબોધિત કરે છે, એક નવીન પિકોલીલ (Pic)-આધારિત કેજિંગ/અનકેજિંગ વ્યૂહરચના વિકસાવે છે. સરળ pH અને તરંગલંબાઇ નિયંત્રણ દ્વારા, આ કાર્ય Cys અવશેષોનું કાર્યક્ષમ, ઓર્થોગોનલ રક્ષણ પ્રાપ્ત કરે છે. ઇન્ટરલ્યુકિન-4 (IL-4) અને ટ્યુમર નેક્રોસિસ ફેક્ટર-α (TNF-α) જેવા જટિલ પ્રોટીનના સંશ્લેષણમાં તેનો સફળતાપૂર્વક ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો છે, જે ચોક્કસ પ્રોટીન ફેરફાર અને સંશ્લેષણ માટે એક નવીન સાધન પૂરું પાડે છે.

આજે, અમે ઝેંગબિયાઓ ઝાંગની ટીમના નેતૃત્વ હેઠળના મહત્વપૂર્ણ સંશોધનને શેર કરીએ છીએ, જે એન્જેવાન્ડે કેમી ઇન્ટરનેશનલ એડિશનમાં પ્રકાશિત થયું છે. આ અભ્યાસમાં નવીન ડ્યુઅલ સ્વ-પ્રમોટેડ રિંગ-ઓપનિંગ પોલિમરાઇઝેશન વ્યૂહરચના દ્વારા વિશાળ ચિરલ સાઇડ ચેઇન ધરાવતા કેશનિક પોલીપેપ્ટોઇડ મિમિક્સને સફળતાપૂર્વક સંશ્લેષિત કરવામાં આવ્યા છે. પરંપરાગત સમજથી વિપરીત, આ કેશનિક પોલીપેપ્ટોઇડ્સે માત્ર હેલિકલ સ્ટ્રક્ચરને વિક્ષેપિત કર્યું નથી પરંતુ તેના બદલે અપવાદરૂપે સ્થિર, પોલીપ્રોલાઇન પ્રકારના I-જેવા હેલિક્સ બનાવ્યા છે. આ કાર્ય પરંપરાગત દાખલાને પડકારે છે કે "કેટેનિક સાઇડ ચેઇન અનિવાર્યપણે હેલિક્સને અસ્થિર કરે છે" અને ઓછી ઝેરીતા અને ઉચ્ચ સેલ્યુલર શોષણ કાર્યક્ષમતાને જોડતા અદ્યતન કાર્યાત્મક પોલિમર ડિઝાઇન કરવા માટે નવા માર્ગો ખોલે છે.

આજે, અમે ડેવિડ બેકર અને ગૌરવ ભારદ્વાજની ટીમોના નેતૃત્વ હેઠળ એક સંશોધન લેખ શેર કરીએ છીએ, જે નેચર કેમિકલ બાયોલોજીમાં પ્રકાશિત થયો છે. આ અભ્યાસમાં RFpeptides વિકસાવવામાં આવ્યું છે, જે એક ડિનોઈઝિંગ ડિફ્યુઝન-આધારિત જનરેટિવ AI પાઇપલાઇન છે જે RoseTTAFold2 (RF2) સ્ટ્રક્ચર પ્રિડિક્શન નેટવર્ક અને RFdiffusion પ્રોટીન બેકબોન જનરેશન ફ્રેમવર્કને એકીકૃત કરીને મેક્રોસાયક્લિક પેપ્ટાઇડ્સના ડી નોવોડિઝાઇનને સક્ષમ કરે છે. આ કાર્ય, પ્રથમ વખત, બહુવિધ પ્રોટીન લક્ષ્યોને લક્ષ્ય બનાવતા હાઇ-એફિનિટી મેક્રોસાયક્લિક પેપ્ટાઇડ બાઈન્ડર્સની ચોક્કસ ડિઝાઇન પ્રાપ્ત કરે છે, જે એક્સ-રે ક્રિસ્ટલોગ્રાફી દ્વારા માન્ય કરવામાં આવે છે જે ડિઝાઇન અને પ્રાયોગિક માળખા (Cα RMSD

આજે, અમે સેલ બાયોમટિરિયલ્સમાં પ્રકાશિત સીઝર ડે લા ફુએન્ટે-નુનેઝની ટીમના નેતૃત્વ હેઠળ એક સંશોધન લેખ શેર કરીએ છીએ. આ અભ્યાસમાં AMP-ડિફ્યુઝન નામનું જનરેટિવ આર્ટિફિશિયલ ઇન્ટેલિજન્સ પ્લેટફોર્મ વિકસાવવામાં આવ્યું છે, જે સુષુપ્ત પ્રસરણ મોડેલો અને પ્રોટીન ભાષા મોડેલો (pLMs) ને એકીકૃત કરીને એન્ટિમાઇક્રોબાયલ પેપ્ટાઇડ્સ (AMPs) ના ડી-નોવોડિઝાઇનને સક્ષમ કરે છે. આ કાર્ય પૂર્વનિર્ધારિત રૂપરેખાઓ અથવા માળખાકીય પૂર્વવર્તીઓની જરૂર વગર સીધા ESM-2 એમ્બેડિંગ સ્પેસમાંથી કાર્યાત્મક પેપ્ટાઇડ્સ ઉત્પન્ન કરે છે. પ્રાયોગિક માન્યતા દર્શાવે છે કે જનરેટ થયેલા પેપ્ટાઇડ્સમાંથી 76% બ્રોડ-સ્પેક્ટ્રમ એન્ટિમાઇક્રોબાયલ પ્રવૃત્તિ (મલ્ટિડ્રગ-પ્રતિરોધક બેક્ટેરિયા સામે સહિત) દર્શાવે છે, જેમાં પ્રમાણભૂત એન્ટિબાયોટિક્સ સાથે તુલનાત્મક ઇન વિવો અસરકારકતા છે, જે એન્ટિબાયોટિક પ્રતિકાર કટોકટીને સંબોધવા માટે એક સ્કેલેબલ, તર્કસંગત ડિઝાઇન સાધન પૂરું પાડે છે.

આજે, આપણે નેચર કોમ્યુનિકેશન્સમાં પ્રકાશિત ઇવા સ્ઝ્ઝુરેકની ટીમના નેતૃત્વ હેઠળના એક સંશોધન લેખ શેર કરીએ છીએ. આ અભ્યાસમાં હાઇડ્રામ્પ નામનું એક ઊંડા જનરેટિવ મોડેલ વિકસાવવામાં આવ્યું છે, જે એક શરતી વેરિયેશનલ ઓટોએન્કોડર (cVAE) છે જે પેપ્ટાઇડ્સના સતત ઓછા-પરિમાણીય પ્રતિનિધિત્વને શીખીને ઉચ્ચ એન્ટિમાઇક્રોબાયલ પ્રવૃત્તિ સાથે નોવેલ એન્ટિમાઇક્રોબાયલ પેપ્ટાઇડ્સ (AMPs) ઉત્પન્ન કરે છે. આ કાર્ય વેટ-લેબ પ્રયોગો દ્વારા માન્ય કરાયેલા જનરેટ કરેલા પેપ્ટાઇડ્સના અસાધારણ એન્ટિબેક્ટેરિયલ અસરો સાથે, જાણીતા સક્રિય/નિષ્ક્રિય પેપ્ટાઇડ્સના એનાલોગના નિયંત્રણક્ષમ ઉત્પાદનને પ્રાપ્ત કરવા માટેનું પ્રથમ કાર્ય છે. તે વૈશ્વિક એન્ટિમાઇક્રોબાયલ પ્રતિકાર સંકટને સંબોધવા માટે એક શક્તિશાળી ગણતરીત્મક ડિઝાઇન સાધન પૂરું પાડે છે.