ການສັງເຄາະ peptide

ມື້ນີ້, ພວກເຮົາຂໍແບ່ງປັນການຄົ້ນຄວ້າທີ່ສຳຄັນຈາກທີມງານຂອງສາດສະດາຈານ Hiroaki Suga ທີ່ມະຫາວິທະຍາໄລໂຕກຽວ, ເຊິ່ງໄດ້ຈັດພິມໃນ Angewandte Chemie International Edition, ທີ່ມີຫົວຂໍ້ວ່າ "ການສັງເຄາະ Ribosomal ຂອງ peptides Bicyclic ທີ່ກຳນົດທາງດ້ານ Topologically Defined Thioisoindole-Bridged." ການສຶກສານີ້ໄດ້ພັດທະນາຍຸດທະສາດສັງເຄາະແບບໃໝ່ສຳລັບ peptides bicyclic ໂດຍອີງໃສ່ການເຊື່ອມໂຍງ thioisoindole. ໂດຍການອອກແບບກົດອະມິໂນ 2-nicotinoylbenzaldehyde ທີ່ປ້ອງກັນດ້ວຍ semicarbazone (Ac-Ala(NtBA)Sc-CME) ເປັນຕົວເລີ່ມຕົ້ນການແປພາສາ, ມັນໄດ້ຖືກລວມເຂົ້າກັບຕ່ອງໂສ້ peptide ຢ່າງມີປະສິດທິພາບໂດຍໃຊ້ລະບົບ in vitrotranslation (FIT) ທີ່ມີຄວາມຍືດຫຍຸ່ນ. ຕໍ່ມາ, ການປິ່ນປົວດ້ວຍກົດອ່ອນໆໄດ້ກະຕຸ້ນປະຕິກິລິຍາ bicyclization ພາຍໃນໂມເລກຸນ, ເພື່ອສ້າງ peptides bicyclic ທີ່ມີຄວາມແມ່ນຍຳທາງໂຄງສ້າງຢ່າງສຳເລັດຜົນ. ວິທີການນີ້ເຂົ້າກັນໄດ້ຢ່າງເຕັມທີ່ກັບເທັກໂນໂລຢີການສະແດງ mRNA, ເຊິ່ງເປັນເວທີທີ່ມີປະສິດທິພາບສຳລັບການສ້າງຫ້ອງສະໝຸດ peptide bicyclic ຂະໜາດໃຫຍ່ທີ່ກຳນົດທາງດ້ານ Topologically ສຳລັບການຄົ້ນພົບຢາ.

ມື້ນີ້ພວກເຮົາແບ່ງປັນຜົນການຄົ້ນຄວ້າທີ່ສຳຄັນທີ່ເຜີຍແຜ່ໃນ Science Advances ໂດຍທີມງານວິທະຍາສາດຈີນ. ການສຶກສາລາຍງານເຕັກໂນໂລຊີການປະສົມຊີວະພາບແບບເລືອກ cysteine ​​(Cys) ແບບໃໝ່ໂດຍອີງໃສ່ໂຄງສ້າງແບບໂມດູນ 1,3,5-triazine—Triazine-Pyridinium Chemistry (TPC). ວຽກງານນີ້ແກ້ໄຂຄວາມຕ້ອງການທີ່ສຳຄັນສຳລັບສານປະສົມ Cys-selective ທີ່ມີຄວາມໝັ້ນຄົງສູງໃນການນຳໃຊ້ການປິ່ນປົວເຊັ່ນ: ສານປະສົມຢາຕ້ານເຊື້ອ (ADCs). ຜ່ານການດັດແປງໂຄງສ້າງຢ່າງເປັນລະບົບ ແລະ ການສຶກສາການຄິດໄລ່, ທີມງານໄດ້ເພີ່ມປະສິດທິພາບສານປະສົມທີ່ສາມາດບັນລຸການຕິດສະຫຼາກ Cys (ຜົນຜະລິດ>95%) ໃນປະລິມານທີ່ໃກ້ຄຽງກັບສະພາບທາງສະລີລະວິທະຍາ (pH 7.4), ໃນຂະນະທີ່ສະກັດກັ້ນປະຕິກິລິຍາຕໍ່ ​​tyrosine (Tyr) ຢ່າງມີປະສິດທິພາບ, ເອົາຊະນະຂໍ້ຈຳກັດຂອງໂພຣບ TPC ໃນຕອນຕົ້ນ. ການສຶກສາໄດ້ສະແດງໃຫ້ເຫັນເຖິງຄວາມເຂົ້າກັນໄດ້ດີຂອງມັນກັບ peptides ແລະ ໂປຣຕີນຕ່າງໆ, ລວມທັງຢາຕ້ານເຊື້ອ trastuzumab ໃນການປິ່ນປົວ, ແລະ ສະແດງໃຫ້ເຫັນທ່າແຮງຂອງມັນໃນການສ້າງ ADCs. ວິທີການຕິດສະຫຼາກທີ່ດີທີ່ສຸດຮັບປະກັນຄວາມໝັ້ນຄົງທີ່ດີເລີດຂອງສານປະສົມໃນສະພາບແວດລ້ອມທາງຊີວະພາບ, ເນັ້ນໃຫ້ເຫັນເຖິງຄຸນຄ່າການນຳໃຊ້ຕົວຈິງຂອງວິທີການນີ້.

ມື້ນີ້, ພວກເຮົາແບ່ງປັນບົດຄວາມຄົ້ນຄວ້າທີ່ສຳຄັນທີ່ຕີພິມໃນວາລະສານ Organic Process Research & Development ໂດຍທີມງານຂອງ Tomohiro Hattori ແລະ Hisashi Yamamoto ຈາກສູນວິທະຍາສາດ Peptide ທີ່ມະຫາວິທະຍາໄລ Chubu, ປະເທດຍີ່ປຸ່ນ. ການສຶກສານີ້ໄດ້ພັດທະນາຍຸດທະສາດການສັງເຄາະສານເຄມີໄຫຼແບບໃໝ່ໂດຍອີງໃສ່ pentafluorophenyl (Pfp) esters. ຫຼັກຂອງວິທີການນີ້ແມ່ນເພື່ອນຳໃຊ້ປະຕິກິລິຍາ ແລະ ຄວາມໝັ້ນຄົງສູງຂອງ Pfp esters ເພື່ອໃຫ້ໄດ້ການຄວບແໜ້ນທີ່ມີປະສິດທິພາບ ແລະ ວ່ອງໄວດ້ວຍ stoichiometric acid esters - ລວມທັງ N-methyl amino acid esters ທີ່ທ້າທາຍສູງ - ໂດຍບໍ່ຕ້ອງໃຊ້ສານເພີ່ມເຕີມໃດໆ. ການຄົ້ນຄວ້າຍັງໄດ້ສ້າງຕັ້ງລະບົບການໄຫຼຢ່າງຕໍ່ເນື່ອງທີ່ປະສົມປະສານກັບໂພລີເມີ DBU ສຳລັບການຫຼຸດລະດັບອອນໄລນ໌, ເຊິ່ງສຳເລັດການປະກອບຕາມລຳດັບຈາກ dipeptides ໄປຫາ pentapeptides (ລວມທັງລຳດັບຊີວະພາບເຊັ່ນ Leu-enkephalin ແລະ thymopentin). ຜະລິດຕະພັນໄດ້ຮັບດ້ວຍຄວາມບໍລິສຸດສູງ, ແລະ ລະບົບດັ່ງກ່າວໄດ້ເຮັດໃຫ້ການສັງເຄາະແບບອັດຕະໂນມັດ ແລະ ໄລຍະຍາວໃນລະດັບກຣາມ. ວຽກງານນີ້ສະໜອງວິທີແກ້ໄຂແບບໃໝ່ສຳລັບການພັດທະນາຂະບວນການຜະລິດທີ່ເປັນມິດກັບສິ່ງແວດລ້ອມ, ມີປະສິດທິພາບ ແລະ ສາມາດຂະຫຍາຍໄດ້ສຳລັບຢາ peptide.

ມື້ນີ້, ພວກເຮົາຂໍແບ່ງປັນບົດຄວາມຄົ້ນຄວ້າທີ່ສຳຄັນຈາກທີມງານທີ່ນຳພາໂດຍ Lin Dong, ເຊິ່ງໄດ້ຈັດພິມໃນ Organic Letters. ວຽກງານນີ້ແກ້ໄຂບັນຫາທີ່ຫຍຸ້ງຍາກ ແລະ ຂັ້ນຕອນທີ່ຫຍຸ້ງຍາກໃນການສັງເຄາະ peptide ໄລຍະແຂງ (SPPS) ສຳລັບຢາ peptide Tirzepatide (ຕົວກະຕຸ້ນສອງເປົ້າໝາຍແບບໃໝ່ສຳລັບການປິ່ນປົວພະຍາດເບົາຫວານປະເພດ 2 ແລະ ໂລກອ້ວນ) ໂດຍການພັດທະນາຍຸດທະສາດການສັງເຄາະ peptide ໄລຍະແຫຼວແບບ hydrophobic tag-assisted (LPPS). ວິທີການນີ້ແນະນຳແທັກ hydrophobic ທີ່ລະລາຍໄດ້ (TAGa ແລະ TAGb), ໂດຍນຳໃຊ້ຄຸນສົມບັດການລະລາຍທີ່ເປັນເອກະລັກຂອງພວກມັນເພື່ອໃຫ້ໄດ້ການແຍກທີ່ມີປະສິດທິພາບ, ຫຼຸດຜ່ອນສິ່ງເສດເຫຼືອຂອງກົດອະມິໂນ ແລະ ຕົວລະລາຍຢ່າງຫຼວງຫຼາຍ. ມັນຍັງໃຊ້ຍຸດທະສາດການປົກປ້ອງຄູ່ (Cbz/Fmoc) ໃນ lysine ເພື່ອຄວບຄຸມການປະກອບລະບົບຕ່ອງໂສ້ຂ້າງຢ່າງແນ່ນອນ, ໃນທີ່ສຸດກໍ່ສັງເຄາະ Tirzepatide 39-ກົດອະມິໂນດ້ວຍຜົນຜະລິດສູງ. ວຽກງານນີ້ໃຫ້ວິທີການໃໝ່ສຳລັບການຜະລິດຢາ peptide ທີ່ສັບສົນໃນຂະໜາດໃຫຍ່ທີ່ເປັນມິດກັບສິ່ງແວດລ້ອມ ແລະ ປະຫຍັດ.

ມື້ນີ້, ພວກເຮົາຂໍແບ່ງປັນການຄົ້ນຄວ້າທີ່ສຳຄັນຈາກທີມງານທີ່ນຳພາໂດຍ Xinxiang Lei ຈາກມະຫາວິທະຍາໄລ Lanzhou, ເຊິ່ງໄດ້ຈັດພິມໃນ Angewandte Chemie International Edition. ວຽກງານນີ້ໝາຍເຖິງການນຳໃຊ້ເຄມີ photoclick thiol-ene ຄັ້ງທຳອິດໃນການ bicyclization ທີ່ມີປະສິດທິພາບຂອງ peptides ທີ່ບໍ່ໄດ້ຮັບການປົກປ້ອງ, ພັດທະນາວິທີການໃໝ່ທີ່ວ່ອງໄວ, ຄັດເລືອກສູງ, ແລະ ເຂົ້າກັນໄດ້ກັບຊີວະພາບສູງ. ນັກຄົ້ນຄວ້າໄດ້ນຳໃຊ້ TAIC tri-alkene crosslinker ທີ່ມີລາຄາບໍ່ແພງ ແລະ ສາມາດຊອກຫາໄດ້ງ່າຍ. ພາຍໃຕ້ການກະຕຸ້ນແສງທີ່ເບິ່ງເຫັນໄດ້, cyclization ຈະສຳເລັດພາຍໃນເວລາພຽງ 6 ນາທີ. ພວກເຂົາໄດ້ປະສົມປະສານສິ່ງນີ້ກັບເທັກໂນໂລຢີການສະແດງ phage ເພື່ອສ້າງຫ້ອງສະໝຸດ peptide bicyclic ທີ່ຖືກລະຫັດພັນທຸກໍາ, ກວດສອບ ligands ໃໝ່ທີ່ມີຄວາມຜູກພັນ sub-micromolar ສູງຫຼາຍສຳລັບຢາເປົ້າໝາຍທີ່ສຳຄັນ cyclophilin A. ການສຶກສານີ້ໃຫ້ເວທີໃໝ່ທີ່ມີປະສິດທິພາບ ແລະ ຫຼາກຫຼາຍສຳລັບການຄົ້ນພົບຢາ peptide ທີ່ມີຂໍ້ຈຳກັດ.

ມື້ນີ້, ພວກເຮົາຈະແບ່ງປັນການຄົ້ນຄວ້າທີ່ສຳຄັນກັບທ່ານທີ່ນຳພາໂດຍທີມງານຂອງສາດສະດາຈານ Ping Wang ທີ່ມະຫາວິທະຍາໄລ Shanghai Jiao Tong, ເຊິ່ງໄດ້ຈັດພິມໃນ Angewandte Chemie International Edition. ການສຶກສານີ້ແກ້ໄຂບັນຫາທ້າທາຍຫຼັກຂອງການປົກປ້ອງແບບເລືອກເຟັ້ນ ແລະ ການປ້ອງກັນ cysteine ​​(Cys) ໃນການສັງເຄາະສານເຄມີໂປຣຕີນ, ໂດຍການພັດທະນາຍຸດທະສາດ caging/uncaging ທີ່ອີງໃສ່ picolyl (Pic). ຜ່ານການຄວບຄຸມ pH ແລະ ຄວາມຍາວຄື້ນແບບງ່າຍໆ, ວຽກງານນີ້ບັນລຸການປົກປ້ອງ Cys residues ທີ່ມີປະສິດທິພາບ ແລະ orthogonal. ມັນໄດ້ຖືກນຳໃຊ້ຢ່າງສຳເລັດຜົນກັບການສັງເຄາະໂປຣຕີນທີ່ສັບສົນເຊັ່ນ Interleukin-4 (IL-4) ແລະ Tumor Necrosis Factor-α (TNF-α), ເຊິ່ງເປັນເຄື່ອງມືທີ່ມີນະວັດຕະກຳສຳລັບການດັດແປງ ແລະ ການສັງເຄາະໂປຣຕີນທີ່ຊັດເຈນ.

ມື້ນີ້, ພວກເຮົາຂໍແບ່ງປັນການຄົ້ນຄວ້າທີ່ສຳຄັນທີ່ນຳພາໂດຍທີມງານຂອງ Zhengbiao Zhang, ເຊິ່ງໄດ້ຈັດພິມໃນ Angewandte Chemie International Edition. ການສຶກສານີ້ໄດ້ສັງເຄາະ polypeptoid cationic ທີ່ຄ້າຍຄືກັບຕ່ອງໂສ້ຂ້າງ chiral ຂະໜາດໃຫຍ່ຜ່ານກົນລະຍຸດການໂພລີເມີໄຣເຊຊັນເປີດວົງແຫວນຄູ່ທີ່ສົ່ງເສີມດ້ວຍຕົນເອງ. ກົງກັນຂ້າມກັບຄວາມເຂົ້າໃຈແບບດັ້ງເດີມ, polypeptoids cationic ເຫຼົ່ານີ້ບໍ່ພຽງແຕ່ບໍ່ໄດ້ທຳລາຍໂຄງສ້າງ helical ເທົ່ານັ້ນແຕ່ຍັງໄດ້ສ້າງ helices ຄ້າຍຄື polyproline ປະເພດ I ທີ່ໝັ້ນຄົງເປັນພິເສດ. ວຽກງານນີ້ທ້າທາຍຮູບແບບພື້ນເມືອງທີ່ວ່າ "ຕ່ອງໂສ້ຂ້າງ cationic ເຮັດໃຫ້ helices ບໍ່ໝັ້ນຄົງຢ່າງຫຼີກລ່ຽງບໍ່ໄດ້" ແລະເປີດຊ່ອງທາງໃໝ່ສຳລັບການອອກແບບໂພລີເມີທີ່ເຮັດວຽກຂັ້ນສູງທີ່ປະສົມປະສານຄວາມເປັນພິດຕ່ຳ ແລະປະສິດທິພາບການດູດຊຶມຂອງເຊລສູງ.

ມື້ນີ້, ພວກເຮົາຂໍແບ່ງປັນບົດຄວາມຄົ້ນຄວ້າທີ່ນຳພາໂດຍທີມງານຂອງ David Baker ແລະ Gaurav Bhardwaj, ເຊິ່ງໄດ້ຕີພິມໃນວາລະສານ Nature Chemical Biology. ການສຶກສານີ້ໄດ້ພັດທະນາ RFpeptides, ເຊິ່ງເປັນທໍ່ສົ່ງ AI ທີ່ສ້າງຂື້ນໂດຍອີງໃສ່ການແຜ່ກະຈາຍທີ່ຫຼຸດຜ່ອນສຽງລົບກວນ ເຊິ່ງຊ່ວຍໃຫ້ສາມາດອອກແບບ peptides macrocyclic ຄືນໃໝ່ໄດ້ໂດຍການລວມເອົາເຄືອຂ່າຍການຄາດຄະເນໂຄງສ້າງ RoseTTAFold2 (RF2) ແລະຂອບການຜະລິດກະດູກສັນຫຼັງຂອງໂປຣຕີນ RFdiffusion. ວຽກງານນີ້ບັນລຸໄດ້, ເປັນຄັ້ງທຳອິດ, ການອອກແບບທີ່ຊັດເຈນຂອງຕົວຍຶດ peptide macrocyclic ທີ່ມີຄວາມຜູກພັນສູງທີ່ແນໃສ່ເປົ້າໝາຍໂປຣຕີນຫຼາຍອັນ, ເຊິ່ງໄດ້ຮັບການຢືນຢັນໂດຍ crystallography X-ray ສະແດງໃຫ້ເຫັນເຖິງຄວາມສອດຄ່ອງສູງລະຫວ່າງໂຄງສ້າງທີ່ອອກແບບ ແລະ ທົດລອງ (Cα RMSD

ມື້ນີ້, ພວກເຮົາແບ່ງປັນບົດຄວາມຄົ້ນຄວ້າທີ່ນຳພາໂດຍທີມງານຂອງ Cesar de la Fuente-Nunez, ເຊິ່ງໄດ້ຕີພິມໃນ Cell Biomaterials. ການສຶກສານີ້ໄດ້ພັດທະນາແພລດຟອມປັນຍາປະດິດທີ່ມີຊື່ວ່າ AMP-Diffusion, ເຊິ່ງຊ່ວຍໃຫ້ສາມາດອອກແບບ peptide ຕ້ານເຊື້ອຈຸລິນຊີ (AMPs) ໄດ້ໂດຍການລວມເອົາຮູບແບບການແຜ່ກະຈາຍແຝງ ແລະ ຮູບແບບພາສາໂປຣຕີນ (pLMs). ວຽກງານນີ້ສ້າງ peptides ທີ່ເຮັດວຽກໄດ້ໂດຍກົງຈາກພື້ນທີ່ຝັງ ESM-2 ໂດຍບໍ່ຕ້ອງມີຮູບແບບທີ່ກຳນົດໄວ້ລ່ວງໜ້າ ຫຼື ໂຄງສ້າງກ່ອນ. ການຢັ້ງຢືນການທົດລອງສະແດງໃຫ້ເຫັນວ່າ 76% ຂອງ peptides ທີ່ສ້າງຂຶ້ນສະແດງໃຫ້ເຫັນກິດຈະກຳຕ້ານເຊື້ອຈຸລິນຊີທີ່ກວ້າງຂວາງ (ລວມທັງການຕໍ່ຕ້ານເຊື້ອແບັກທີເຣຍທີ່ຕ້ານທານຢາຫຼາຍຊະນິດ), ໂດຍມີປະສິດທິພາບໃນຮ່າງກາຍທຽບເທົ່າກັບຢາຕ້ານເຊື້ອມາດຕະຖານ, ສະໜອງເຄື່ອງມືອອກແບບທີ່ສົມເຫດສົມຜົນ ແລະ ສາມາດຂະຫຍາຍໄດ້ເພື່ອແກ້ໄຂວິກິດການຕ້ານທານຢາຕ້ານເຊື້ອ.

ມື້ນີ້, ພວກເຮົາຂໍແບ່ງປັນບົດຄວາມຄົ້ນຄວ້າທີ່ນຳພາໂດຍທີມງານຂອງ Ewa Szczurek, ເຊິ່ງໄດ້ຕີພິມໃນວາລະສານ Nature Communications. ການສຶກສານີ້ໄດ້ພັດທະນາຮູບແບບການສ້າງແບບເລິກເຊິ່ງຊື່ວ່າ HydrAMP, ເຊິ່ງເປັນຕົວເຂົ້າລະຫັດອັດຕະໂນມັດແບບມີເງື່ອນໄຂ (cVAE) ທີ່ສ້າງ peptide ຕ້ານເຊື້ອຈຸລິນຊີຊະນິດໃໝ່ (AMPs) ທີ່ມີກິດຈະກຳຕ້ານເຊື້ອຈຸລິນຊີສູງໂດຍການຮຽນຮູ້ການສະແດງ peptides ທີ່ມີມິຕິຕ່ຳຢ່າງຕໍ່ເນື່ອງ. ວຽກງານນີ້ແມ່ນວຽກງານທຳອິດທີ່ບັນລຸການຜະລິດ peptides ທີ່ມີການເຄື່ອນໄຫວ/ບໍ່ມີການເຄື່ອນໄຫວທີ່ຮູ້ຈັກທີ່ສາມາດຄວບຄຸມໄດ້, ດ້ວຍຜົນກະທົບຕ້ານເຊື້ອແບັກທີເຣຍທີ່ໂດດເດັ່ນຂອງ peptides ທີ່ສ້າງຂຶ້ນທີ່ໄດ້ຮັບການຢືນຢັນຜ່ານການທົດລອງໃນຫ້ອງທົດລອງປຽກ. ມັນໃຫ້ເຄື່ອງມືອອກແບບການຄິດໄລ່ທີ່ມີປະສິດທິພາບເພື່ອແກ້ໄຂວິກິດການຕ້ານທານຢາຕ້ານເຊື້ອທົ່ວໂລກ.