Fmoc Solid-Phase Peptide Synthesis နှင့် Common Fmoc-Protected Amino Acids
Fmoc Solid-Phase Synthesis အကြောင်း နိဒါန်း
Fmoc အစိုင်အခဲ-အဆင့်ပေါင်းစပ်ပေါင်းစပ်မှုကို Eric Atherton နှင့် Bob Sheppard မှ 1970 ခုနှစ်နှောင်းပိုင်းတွင် Cambridge တက္ကသိုလ်မှ (Chan and White မှစနစ်တကျပြန်လည်သန့်စင်ခဲ့သည်)။ ၎င်း၏ ပင်မနည်းစနစ်တွင် Fmoc (9-fluorenylmethoxycarbonyl) အုပ်စုကို အသုံးပြုသည်။ အမိုင်နိုအက်ဆစ်များအတွက် α-အမိုင်နိုကာကွယ်သည့်အုပ်စု။ Peptide ကွင်းဆက်များကို နူးညံ့သိမ်မွေ့သော piperidine deprotection (peptide ကွင်းဆက်သို့ အက်ဆစ်ကြောင့်ဖြစ်စေသော ပျက်စီးမှုကို ရှောင်ရှားခြင်း) နှင့် activated carboxyl-group coupling တို့ဖြင့် မပျော်ဝင်နိုင်သော အစေးပေါ်တွင် အဆင့်ဆင့် ပေါင်းစပ်ထားသည်။ အဓိကအားသာချက်များပါဝင်သည်-
1.နူးညံ့မှုနှင့် ဘေးကင်းမှု-
Fmoc အုပ်စုသည် အက်ဆစ်များ (ဥပမာ၊ TFA) ကို ပြင်းထန်စွာ ခံနိုင်ရည်ရှိပြီး ဘေးထွက်ကွင်းဆက်ကို ကာကွယ်သည့်အဖွဲ့များ (ဥပမာ Boc) သည် အက်ဆစ်ဖြင့် ခွဲထုတ်ခြင်း လိုအပ်ပါသည်။
Boc ဓာတုဗေဒတွင် ထပ်ခါတလဲလဲ ပြင်းထန်သောအက်ဆစ်ကုသမှုများနှင့် ဆက်စပ်နေသော ဘေးထွက်တုံ့ပြန်မှုအန္တရာယ်များကို ဖယ်ရှားပေးရန်အတွက် အစေးမှ peptide ကို တစ်ပြိုင်နက်ထုတ်လွှတ်ပေးရန်နှင့် ဘေးထွက်ကွင်းဆက်ကာကွယ်မှုများကို ဖယ်ရှားရန်အတွက် TFA ပိုင်းခြားမှုအဆင့်တစ်ခုတည်းသာ လိုအပ်ပါသည်။
2. ထိရောက်မှုနှင့် ထိန်းချုပ်မှု-
အဆင့်ဆင့်ဆေးကြောခြင်းဖြင့် ရလဒ်များကို လျင်မြန်စွာ ဖယ်ရှားသည်။
Fmoc အုပ်စု၏ လက္ခဏာရပ်ဖြစ်သော ခရမ်းလွန်ရောင်ခြည် စုပ်ယူမှုသည် အချိန်နှင့်တပြေးညီ တုံ့ပြန်မှုကို စောင့်ကြည့်နိုင်စေသည်။
3. စွယ်စုံရအပလီကေးရှင်း လိုက်ဖက်ညီမှု-
အက်ဆစ်-ထိခိုက်လွယ်သော အမိုင်နိုအက်ဆစ်များ (ဥပမာ၊ tryptophan/methionine) နှင့် ရှုပ်ထွေးသော ပြုပြင်ထားသော peptides တို့နှင့် တွဲဖက်အသုံးပြုနိုင်သည်။
သမားရိုးကျ Boc ပေါင်းစပ်မှုကို တဖြည်းဖြည်း အစားထိုးသည့် စက်မှုလုပ်ငန်းသုံး peptide ဆေးများ (ဥပမာ Dilunbio 386 Pro) နှင့် အလိုအလျောက် peptide ပေါင်းစပ်မှုများအတွက် အခြေခံနည်းပညာအဖြစ် ဆောင်ရွက်ပါသည်။
အောက်ဖော်ပြပါဇယားသည် အစိုင်အခဲအဆင့် peptide ပေါင်းစပ်မှုတွင် အသုံးပြုလေ့ရှိသော Fmoc-amino acids များကို စုစည်းထားသည်။
| Solid-Phase Peptide Synthesis အတွက် အသုံးများသော Fmoc-Protected Amino Acids | ||||||
| ကုတ် | နာမည် | မဂ္ဂါဝပ် | ဖွဲ့စည်းတည်ဆောက်ပုံဖော်မြူလာ | မော်လီကျူးဖော်မြူလာ | CAS | သတ္တိ |
| တစ် | Fmoc-Ala-OH | ၃၁၁.၃၃ |
| ဂ၁၈ဇ၁၇မဟုတ်ဘူး၄ | ၃၅၆၆၁-၃၉-၃ | ကြားနေတာဝန်ခံပါရှိသော Aliphatic hydrophobic အမိုင်နိုအက်ဆစ် |
| R | Fmoc-Arg(Pbf)-OH | ၆၄၈.၇၇ |
| ဂ၃၄ဇ၄၀N၄THE၇၎ | ၁၅၄၄၄၅-၇၇-၉ | Pbf-protected guanidyl အုပ်စုပါ၀င်ရိုးစွန်းအမိုင်နိုအက်ဆစ်သည် ဘေးထွက်တုံ့ပြန်မှုများကို ပိတ်ဆို့ထားသည်။ |
| N | Fmoc-Asn(Trt)-OH | ၅၉၆.၆၇ |
| ဂ၃၈ဇ၃၂N၂THE၅ | ၁၃၂၃၈၈-၅၉-၁ | Polar charge-neutral amino acid ပါဝင်သော Trt-protected amide moiety hydrolysis ကို ခံနိုင်ရည်ရှိသည်။ |
| ဃ | Fmoc-Asp(OtBu)-OH | ၄၁၁.၄၅ |
| ဂ၂၃ဇ၂၅မဟုတ်ဘူး၆ | ၇၁၉၈၉-၁၄-၅ | မရည်ရွယ်ဘဲ ပေါင်းစည်းခြင်းကို နှိမ်နင်းသော OtBu-protected β-carboxyl အုပ်စုပါရှိသော အက်ဆစ်ဝင်ရိုးစွန်းအမိုင်နိုအက်ဆစ် |
| ဂ | Fmoc-Cys(Trt)-OH | ၅၈၅.၇၁ |
| ဂ၃၇ဇ၃၁မဟုတ်ဘူး၄၎ | ၁၀၃၂၁၃-၃၂-၇ | Trt-protected thiol အုပ်စုဖြင့် ဆာလဖာပါဝင်သော ဝင်ရိုးစွန်းကြားနေ အမိုင်နိုအက်ဆစ်သည် ဓာတ်တိုးခြင်းကို ကာကွယ်ပေးသည် |
| AND | Fmoc-Gln(Trt)-OH | 610.70 |
| ဂ၃၉ဇ၃၄N၂THE၅ | ၁၃၂၃၂၇-၈၀-၁ | Polar charge-neutral amino acid Trt-protected carboxamide အုပ်စုပါရှိသည်။ |
| မေး | Fmoc-Glu(OtBu)-OH | ၄၂၅.၄၇ |
| ဂ၂၄ဇ၂၇မဟုတ်ဘူး၆ | ၇၁၉၈၉-၁၈-၉ | OtBu-protected γ-carboxyl အုပ်စုဖြင့် အက်ဆစ်ဝင်ရိုးစွန်းအမိုင်နိုအက်ဆစ် |
| ဆ | Fmoc-Gly-OH | ၂၉၇.၃၁ |
| ဂ၁၇ဇ၁၅မဟုတ်ဘူး၄ | ၂၉၀၂၂-၁၁-၅ | အရိုးရှင်းဆုံး aliphatic hydrophobic အမိုင်နိုအက်ဆစ်သည် ကြားနေတာဝန်ခံနှင့် chiral မဟုတ်သော ဖွဲ့စည်းပုံပါရှိသည်။ |
| ဇ | Fmoc-His(Trt)-OH | ၆၁၉.၇၁ |
| ဂ၄၀ဇ၃၃N၃THE၄ | ၁၀၉၄၂၅-၅၁-၆ | အခြေခံဝင်ရိုးစွန်းအမိုင်နိုအက်ဆစ် Trt-protected imidazolyl အုပ်စုပါဝင်သော |
| ငါ | Fmoc-Ile-OH | ၃၅၃.၄၁ |
| ဂ၂၁ဇ၂၃မဟုတ်ဘူး၄ | ၇၁၉၈၉-၂၃-၆ | အကိုင်းအခက်-ကွင်းဆက် aliphatic hydrophobic အမိုင်နိုအက်ဆစ်သည် ကြားနေတာဝန်ခံဖြစ်သည်။ |
| ဌ | Fmoc-Leu-OH | ၃၅၃.၄၂ |
| C₂₁H₂₃NO₄ | 35661-60-0 | အကိုင်းအခက်-ကွင်းဆက် aliphatic hydrophobic အမိုင်နိုအက်ဆစ်သည် ကြားနေတာဝန်ခံဖြစ်သည်။ |
| K | Fmoc-Lys(Boc)-OH | ၄၆၈.၅၄ |
| C₂₆H₃₂N₂O₆ | ၇၁၉၈၉-၂၆-၉ | Boc-protected ε-amino အုပ်စုနှင့်အတူ အခြေခံဝင်ရိုးစွန်းအမိုင်နိုအက်ဆစ် |
| အမ် | Fmoc-Met-OH | ၃၇၁.၄၅ |
| C₂₀H₂₁NO₄S | ၇၁၉၈၉-၂၈-၁ | Thioether ပါရှိသော hydrophobic အမိုင်နိုအက်ဆစ်၊ oxidizable methylthio moiety ပါရှိသော neutral charge |
| F | Fmoc-Phe-OH | ၃၈၇.၄၃ |
| C₂₄H₂₁NO₄ | ၃၅၆၆၁-၄၀-၆ | phenyl လက်စွပ်ပါရှိသော ကြားနေအားသွင်းဖြင့် ရနံ့ရှိသော hydrophobic အမိုင်နိုအက်ဆစ် |
| P | Fmoc-Pro-OH | ၃၃၇.၃၇ |
| C₂₀H₁₉NO₄ | ၇၁၉၈၉-၃၁-၆ | Heterocyclic အလယ်တန်းအမိုင်နိုအက်ဆစ်သည် ထူးခြားသော ကန့်သတ်ထားသော လက်စွပ်ဖွဲ့စည်းပုံနှင့် hydrophobic ဇာတ်ကောင်ဖြစ်သည်။ |
| ၎ | Fmoc-Ser(tBu)-OH | ၃၈၃.၄၄ |
| C₂₂H₂₅NO₅ | ၇၁၉၈၉-၃၃-၈ | ဟိုက်ဒရော့ဆီလ်ပါဝင်သော ဝင်ရိုးစွန်းအကြွင်းအကျန်၊ ကြားနေအားသွင်းမှု/ tBu-ether ကာကွယ်ထားသော အီသာကွဲအက်မှုကို နှိမ်နင်းသည် |
| T | Fmoc-Thr(tBu)-OH | ၃၉၇.၄၆ |
| C₂₃H₂₇NO₅ | ၇၁၉၈၉-၃၅-၀ | ဝင်ရိုးစွန်း ဟိုက်ဒရိုစီလစ် အမိုင်နိုအက်ဆစ်၊ ကြားနေအားသွင်းမှု/tBu-ကာကွယ်ထားသည်။ |
| IN | Fmoc-Trp(Boc)-OH | ၅၂၆.၅၈ |
| C₃₁H₃₀N₂O₆ | ၁၄၃၈၂၄-၇၈-၆ | Indole ပါဝင်သော မွှေးရနံ့ အကြွင်းအကျန်၊ ဝင်ရိုးစွန်းကြားနေ/Boc-ကာကွယ်ထားသော pyrrole နိုက်ထရိုဂျင် |
| AND | Fmoc-Tyr(tBu)-OH | ၄၅၉.၅၃ |
| C₂₈H₂₉NO₅ | ၇၁၉၈၉-၃၈-၃ | ဖီနိုလစ် ဟိုက်ဒရော့ဆစ် ပါဝင်သော မွှေးရနံ့ အမိုင်နိုအက်ဆစ်၊ ဝင်ရိုးစွန်းကြားနေ/ tBu-ester သည် O-acylation ကို ကာကွယ်ပေးသည် |
| ၌ | Fmoc-Val-OH | ၃၃၉.၃၉ |
| C₂₀H₂₁NO₄ | ၆၈၈၅၈-၂၀-၈ | အကိုင်းအခက်-ကွင်းဆက် aliphatic hydrophobic အမိုင်နိုအက်ဆစ်သည် ကြားနေတာဝန်ခံဖြစ်သည်။ |
