ပက်ပတိုက်ပေါင်းစပ်ခြင်း

ယနေ့တွင်၊ Angewandte Chemie International Edition တွင်ထုတ်ဝေခဲ့သော "Ribosomal Synthesis of Topologically Defined Thioisoindole-Bridged Bicyclic Peptides" ခေါင်းစဉ်ဖြင့် တိုကျိုတက္ကသိုလ်မှ ပါမောက္ခ Hiroaki Suga ၏အဖွဲ့မှ အရေးကြီးသောသုတေသနကို မျှဝေပါသည်။ ဤလေ့လာမှုသည် thioisoindole bridging ကိုအခြေခံ၍ bicyclic peptides အတွက် ထူးခြားသောပေါင်းစပ်နည်းဗျူဟာတစ်ခုကို တီထွင်ခဲ့သည်။ semicarbazone-protected 2-nicotinoylbenzaldehyde amino acid (Ac-Ala(NtBA)Sc-CME) ကို ဘာသာပြန်ဆိုချက်အစပျိုးကိရိယာအဖြစ် ဒီဇိုင်းထုတ်ခြင်းဖြင့်၊ ၎င်းကို ပြောင်းလွယ်ပြင်လွယ်ရှိသော in vitrotranslation (FIT) စနစ်ကို အသုံးပြု၍ peptide chains များတွင် ထိရောက်စွာထည့်သွင်းခဲ့သည်။ ထို့နောက်၊ အပျော့စားအက်ဆစ်ကုသမှုသည် intramolecular bicyclization reaction ကို ဖြစ်ပေါ်စေခဲ့ပြီး ဖွဲ့စည်းပုံအရ တိကျသော bicyclic peptides များကို အောင်မြင်စွာတည်ဆောက်ခဲ့သည်။ ဤနည်းလမ်းသည် mRNA display နည်းပညာနှင့် အပြည့်အဝကိုက်ညီပြီး ဆေးဝါးရှာဖွေတွေ့ရှိမှုအတွက် ကြီးမားသော၊ topologically defined bicyclic peptide libraries များတည်ဆောက်ရန်အတွက် အစွမ်းထက်သောပလက်ဖောင်းတစ်ခုကို ပံ့ပိုးပေးပါသည်။

ယနေ့တွင် ကျွန်ုပ်တို့သည် တရုတ်သိပ္ပံအဖွဲ့တစ်ဖွဲ့မှ Science Advances တွင် ထုတ်ဝေခဲ့သော သိသာထင်ရှားသော သုတေသနတွေ့ရှိချက်များကို မျှဝေပါသည်။ လေ့လာမှုတွင် modular 1,3,5-triazine scaffold—Triazine-Pyridinium Chemistry (TPC) ကို အခြေခံသည့် cysteine ​​(Cys)-selective bioconjugation နည်းပညာအသစ်တစ်ခုကို အစီရင်ခံပါသည်။ ဤလုပ်ငန်းသည် antibody-drug conjugates (ADCs) ကဲ့သို့သော ကုထုံးဆိုင်ရာအသုံးချမှုများတွင် ပိုမိုတည်ငြိမ်မှုရှိသော Cys-selective reagents များအတွက် အရေးတကြီးလိုအပ်ချက်ကို ဖြေရှင်းပေးပါသည်။ စနစ်တကျဖွဲ့စည်းပုံပြုပြင်မွမ်းမံမှုများနှင့် တွက်ချက်မှုဆိုင်ရာလေ့လာမှုများမှတစ်ဆင့် အဖွဲ့သည် ဇီဝကမ္မအခြေအနေများ (pH 7.4) အောက်တွင် Cys (>95% yield) ၏ near-quantitative labeling ကို ရရှိနိုင်သော reagent တစ်ခုကို အကောင်းဆုံးဖြစ်အောင်ပြုလုပ်ခဲ့ပြီး tyrosine (Tyr) အပေါ် တုံ့ပြန်မှုကို ထိရောက်စွာနှိမ်နင်းပေးကာ အစောပိုင်း TPC probes များ၏ ကန့်သတ်ချက်များကို ကျော်လွှားနိုင်ခဲ့သည်။ လေ့လာမှုသည် ကုထုံးဆိုင်ရာ antibody trastuzumab အပါအဝင် peptides နှင့် ပရိုတိန်းအမျိုးမျိုးနှင့် ၎င်း၏ကောင်းမွန်သော တွဲဖက်အသုံးပြုနိုင်မှုကို ပြသခဲ့ပြီး ADCs တည်ဆောက်ရာတွင် ၎င်း၏အလားအလာကို ပြသခဲ့သည်။ အကောင်းဆုံးဖြစ်အောင်ပြုလုပ်ထားသော labeling နည်းလမ်းသည် ဇီဝဗေဒဆိုင်ရာပတ်ဝန်းကျင်များတွင် conjugates များ၏ ကောင်းမွန်သောတည်ငြိမ်မှုကို သေချာစေပြီး ဤချဉ်းကပ်မှု၏ လက်တွေ့အသုံးချမှုတန်ဖိုးကို မီးမောင်းထိုးပြသည်။

ယနေ့တွင် ဂျပန်နိုင်ငံ၊ Chubu တက္ကသိုလ်ရှိ Peptide သိပ္ပံစင်တာမှ Tomohiro Hattori နှင့် Hisashi Yamamoto အဖွဲ့မှ Organic Process Research & Development တွင် ထုတ်ဝေခဲ့သော အရေးကြီးသော သုတေသနဆောင်းပါးတစ်ပုဒ်ကို မျှဝေပါသည်။ အလွန်အကျွံ ဖြည့်စွက်ပစ္စည်းများ အသုံးပြုခြင်း၊ ဘေးထွက်ပစ္စည်း ထုတ်လုပ်ခြင်းနှင့် လုပ်ငန်းစဉ် ရှုပ်ထွေးခြင်းကဲ့သို့သော ရိုးရာ peptide ပေါင်းစပ်မှုတွင် ရေရှည်စိန်ခေါ်မှုများကို ဖြေရှင်းခြင်းဖြင့် ဤလေ့လာမှုသည် pentafluorophenyl (Pfp) esters များကို အခြေခံ၍ ဆန်းသစ်သော စီးဆင်းမှု ဓာတုဗေဒ ပေါင်းစပ်မှု မဟာဗျူဟာတစ်ခုကို တီထွင်ခဲ့သည်။ ဤနည်းလမ်း၏ အဓိကအချက်မှာ မည်သည့်ဖြည့်စွက်ပစ္စည်းများ မလိုအပ်ဘဲ အလွန်စိန်ခေါ်မှုရှိသော N-methyl amino acid esters များအပါအဝင် stoichiometric amino acid esters များနှင့် ထိရောက်ပြီး မြန်ဆန်သော ငွေ့ရည်ဖွဲ့မှုကို ရရှိရန် Pfp esters များ၏ မြင့်မားသော ဓာတ်ပြုမှုနှင့် တည်ငြိမ်မှုကို အသုံးချခြင်းဖြစ်သည်။ သုတေသနသည် အွန်လိုင်း deprotection အတွက် DBU polymer နှင့် ပေါင်းစပ်ထားသော စဉ်ဆက်မပြတ်စီးဆင်းမှုစနစ်ကို ထပ်မံတည်ထောင်ခဲ့ပြီး dipeptides မှ pentapeptides (Leu-enkephalin နှင့် thymopentin ကဲ့သို့သော bioactive sequences များအပါအဝင်) အထိ sequential assembly ကို အောင်မြင်စွာ ပြီးမြောက်အောင် လုပ်ဆောင်နိုင်ခဲ့သည်။ ထုတ်ကုန်များကို မြင့်မားသော သန့်ရှင်းမှုဖြင့် ရရှိခဲ့ပြီး စနစ်သည် ဂရမ်စကေးဖြင့် အလိုအလျောက်၊ ရေရှည်ပေါင်းစပ်မှုကို ပြုလုပ်နိုင်စေခဲ့သည်။ ဤလုပ်ငန်းသည် peptide ဆေးဝါးများအတွက် သဘာဝပတ်ဝန်းကျင်နှင့် သဟဇာတဖြစ်သော၊ ထိရောက်သော နှင့် တိုးချဲ့နိုင်သော ထုတ်လုပ်မှုလုပ်ငန်းစဉ်များ တီထွင်ရန်အတွက် လုံးဝအသစ်စက်စက် ဖြေရှင်းချက်တစ်ခုကို ပေးပါသည်။

ယနေ့တွင်၊ ကျွန်ုပ်တို့သည် Organic Letters တွင်ထုတ်ဝေခဲ့သော Lin Dong ဦးဆောင်သောအဖွဲ့မှ အရေးကြီးသော သုတေသနဆောင်းပါးတစ်ပုဒ်ကို မျှဝေပါသည်။ ဤလုပ်ငန်းသည် peptide ဆေးဝါး Tirzepatide (အမျိုးအစား ၂ ဆီးချိုရောဂါနှင့် အဝလွန်ခြင်းကို ကုသရန်အတွက် dual-target agonist အသစ်) အတွက် solid-phase peptide ပေါင်းစပ်မှု (SPPS) တွင် ကုန်ကျစရိတ်မြင့်မားပြီး လေးလံသော လုပ်ထုံးလုပ်နည်းများ၏ အတားအဆီးများကို hydrophobic tag-assisted liquid-phase peptide ပေါင်းစပ်မှု (LPPS) ဗျူဟာအသစ်တစ်ခုကို တီထွင်ခြင်းဖြင့် ကိုင်တွယ်ဖြေရှင်းသည်။ ဤနည်းလမ်းသည် soluble hydrophobic tags (TAGa နှင့် TAGb) ကို မိတ်ဆက်ပေးပြီး ၎င်းတို့၏ထူးခြားသော ပျော်ဝင်နိုင်စွမ်းဂုဏ်သတ္တိများကို အသုံးပြု၍ ထိရောက်သောခွဲထုတ်မှုကို ရရှိစေကာ အမိုင်နိုအက်ဆစ်နှင့် solvent waste ကို သိသိသာသာလျှော့ချပေးသည်။ ၎င်းသည် lysine တွင် dual-protection (Cbz/Fmoc) ဗျူဟာကိုလည်း အသုံးပြုပြီး side-chain assembly ကို တိကျစွာထိန်းချုပ်ကာ နောက်ဆုံးတွင် မြင့်မားသောအထွက်နှုန်းဖြင့် 39-amino-acid Tirzepatide ကို အောင်မြင်စွာပေါင်းစပ်နိုင်ခဲ့သည်။ ဤလုပ်ငန်းသည် ရှုပ်ထွေးသော peptide ဆေးဝါးများ၏ သဘာဝပတ်ဝန်းကျင်နှင့် စီးပွားရေးအရ ကြီးမားသောထုတ်လုပ်မှုအတွက် ချဉ်းကပ်မှုအသစ်တစ်ခုကို ပံ့ပိုးပေးသည်။

ယနေ့တွင် Angewandte Chemie International Edition တွင်ထုတ်ဝေသော Lanzhou တက္ကသိုလ်မှ Xinxiang Lei ဦးဆောင်သောအဖွဲ့မှ အရေးကြီးသောသုတေသနကို သင့်အားမျှဝေပါသည်။ ဤလုပ်ငန်းသည် အကာအကွယ်မဲ့ peptide များကို ထိရောက်စွာ bicyclization လုပ်ရန် thiol-ene photoclick chemistry ကို ပထမဆုံးအသုံးချခြင်းဖြစ်ပြီး မြန်ဆန်သော၊ အလွန်ရွေးချယ်နိုင်သော နှင့် အလွန်ဇီဝဗေဒနှင့် လိုက်ဖက်သော နည်းလမ်းအသစ်ကို တီထွင်ခဲ့သည်။ သုတေသီများသည် ဈေးသက်သာပြီး အလွယ်တကူရရှိနိုင်သော tri-alkene crosslinker TAIC ကို တီထွင်ခဲ့ကြသည်။ မြင်နိုင်သောအလင်းရောင်အသက်ဝင်မှုအောက်တွင် cyclization ကို မိနစ် ၆ အတွင်း ပြီးမြောက်သည်။ ၎င်းတို့သည် phage display နည်းပညာနှင့် အောင်မြင်စွာပေါင်းစပ်ပြီး မျိုးရိုးဗီဇအရ encoded bicyclic peptide library တစ်ခုတည်ဆောက်ကာ အရေးကြီးသောဆေးဝါးပစ်မှတ် cyclophilin A အတွက် အလွန်မြင့်မားသော sub-micromolar affinity ရှိသော novel ligands များကို စစ်ဆေးသည်။ ဤလေ့လာမှုသည် ကန့်သတ်ထားသော peptide ဆေးဝါးများကို ရှာဖွေတွေ့ရှိရန်အတွက် အစွမ်းထက်ပြီး စွယ်စုံရပလက်ဖောင်းအသစ်တစ်ခုကို ပံ့ပိုးပေးသည်။

ယနေ့တွင် Angewandte Chemie International Edition တွင်ထုတ်ဝေသော Shanghai Jiao Tong တက္ကသိုလ်မှ ပါမောက္ခ Ping Wang ၏အဖွဲ့မှ ဦးဆောင်သော အရေးကြီးသောသုတေသနကို သင့်အား မျှဝေပါသည်။ ဤလေ့လာမှုသည် ပရိုတင်းဓာတုပေါင်းစပ်မှုတွင် cysteine ​​(Cys) ကို ရွေးချယ်ကာကွယ်ခြင်းနှင့် အကာအကွယ်ပေးခြင်း၏ အဓိကစိန်ခေါ်မှုကို ကိုင်တွယ်ဖြေရှင်းပြီး picolyl (Pic)-အခြေခံ caging/uncaging ဗျူဟာအသစ်တစ်ခုကို တီထွင်ခဲ့သည်။ ရိုးရှင်းသော pH နှင့် wavelength ထိန်းချုပ်မှုမှတစ်ဆင့် ဤလုပ်ငန်းသည် Cys အကြွင်းအကျန်များကို ထိရောက်စွာ၊ orthogonal ကာကွယ်မှုကို ရရှိစေသည်။ ၎င်းကို Interleukin-4 (IL-4) နှင့် Tumor Necrosis Factor-α (TNF-α) ကဲ့သို့သော ရှုပ်ထွေးသောပရိုတင်းများပေါင်းစပ်မှုတွင် အောင်မြင်စွာအသုံးချခဲ့ပြီး တိကျသောပရိုတင်းပြုပြင်မှုနှင့် ပေါင်းစပ်မှုအတွက် ဆန်းသစ်သောကိရိယာတစ်ခုကို ပေးစွမ်းခဲ့သည်။

ယနေ့တွင်၊ Angewandte Chemie International Edition တွင်ထုတ်ဝေသော Zhengbiao Zhang ၏အဖွဲ့ဦးဆောင်သော သိသာထင်ရှားသောသုတေသနကို ကျွန်ုပ်တို့မျှဝေပါသည်။ ဤလေ့လာမှုသည် ကြီးမားသော chiral side chains များပါရှိသော cationic polypeptoid အတုများကို ဆန်းသစ်သော dual self-promoted ring-opening polymerization strategy မှတစ်ဆင့် အောင်မြင်စွာပေါင်းစပ်နိုင်ခဲ့သည်။ ရိုးရာနားလည်မှုနှင့်ဆန့်ကျင်ဘက်အနေဖြင့်၊ ဤ cationic polypeptoids များသည် helical structure ကို မနှောင့်ယှက်ရုံသာမက အလွန်တည်ငြိမ်သော polyproline type I-like helices များကို ဖွဲ့စည်းခဲ့သည်။ ဤလုပ်ငန်းသည် "cationic side chains များသည် helices များကို မလွဲမသွေ မတည်မငြိမ်ဖြစ်စေသည်" ဟူသော ရိုးရာပုံစံကို စိန်ခေါ်ပြီး အဆိပ်အတောက်နည်းခြင်းနှင့် မြင့်မားသောဆဲလ်စုပ်ယူမှုထိရောက်မှုကို ပေါင်းစပ်ထားသော အဆင့်မြင့်လုပ်ဆောင်နိုင်သော polymers များကို ဒီဇိုင်းဆွဲရန် လမ်းကြောင်းအသစ်များကို ဖွင့်လှစ်ပေးပါသည်။

ယနေ့တွင်၊ ကျွန်ုပ်တို့သည် Nature Chemical Biology တွင်ထုတ်ဝေသော David Baker နှင့် Gaurav Bhardwaj အဖွဲ့များဦးဆောင်သော သုတေသနဆောင်းပါးတစ်ပုဒ်ကို မျှဝေပါသည်။ ဤလေ့လာမှုသည် RoseTTAFold2 (RF2) ဖွဲ့စည်းပုံခန့်မှန်းချက်ကွန်ရက်နှင့် RFdiffusion protein backbone generation framework ကိုပေါင်းစပ်ခြင်းဖြင့် macrocyclic peptides များ၏ de noise ဒီဇိုင်းကိုပြုလုပ်နိုင်စေသည့် diffusion-based generative AI pipeline တစ်ခုဖြစ်သည့် RFpeptides ကို တီထွင်ခဲ့သည်။ ဤလုပ်ငန်းသည် ဒီဇိုင်းထုတ်ထားသောနှင့် စမ်းသပ်ဖွဲ့စည်းပုံများ (Cα RMSD

ယနေ့တွင်၊ ကျွန်ုပ်တို့သည် Cesar de la Fuente-Nunez ၏အဖွဲ့ ဦးဆောင်သော သုတေသနဆောင်းပါးတစ်ပုဒ်ကို Cell Biomaterials တွင် ထုတ်ဝေခဲ့သည်။ ဤလေ့လာမှုသည် AMP-Diffusion အမည်ရှိ generative artificial intelligence platform တစ်ခုကို တီထွင်ခဲ့ပြီး၊ ၎င်းသည် latent diffusion model များနှင့် protein language model များ (pLM များ) ကို ပေါင်းစပ်ခြင်းဖြင့် antimicrobial peptides (AMPs) ၏ de novodesign ကို ဖြစ်စေသည်။ ဤလုပ်ငန်းသည် ကြိုတင်သတ်မှတ်ထားသော motifs သို့မဟုတ် structural priors များ မလိုအပ်ဘဲ ESM-2 embedding space မှ functional peptides များကို တိုက်ရိုက်ထုတ်ပေးသည်။ စမ်းသပ်မှုအတည်ပြုချက်က ထုတ်လုပ်ထားသော peptides များ၏ 76% သည် broad-spectrum antimicrobial activity (multidrug-resistant bacteria အပါအဝင်) ကို ပြသပြီး standard antibiotics များနှင့် နှိုင်းယှဉ်နိုင်သော in vivo efficacy ရှိပြီး antibiotic resistance အကျပ်အတည်းကို ဖြေရှင်းရန် တိုးချဲ့နိုင်သော၊ ကျိုးကြောင်းဆီလျော်သော ဒီဇိုင်းကိရိယာတစ်ခုကို ပေးစွမ်းသည်။

ယနေ့တွင်၊ Nature Communications တွင်ထုတ်ဝေခဲ့သော Ewa Szczurek ၏အဖွဲ့ဦးဆောင်သော သုတေသနဆောင်းပါးတစ်ပုဒ်ကို ကျွန်ုပ်တို့မျှဝေပါသည်။ ဤလေ့လာမှုသည် HydrAMP အမည်ရှိ နက်ရှိုင်းသော ထုတ်လုပ်မှုပုံစံတစ်ခုကို တီထွင်ခဲ့ပြီး၊ ၎င်းသည် peptide များ၏ စဉ်ဆက်မပြတ် နိမ့်ကျသော ကိုယ်စားပြုမှုများကို သင်ယူခြင်းဖြင့် မြင့်မားသော ပိုးမွှားတိုက်ဖျက်နိုင်စွမ်းရှိသော ထူးခြားသော အဏုဇီဝပိုးများ တိုက်ဖျက်သည့် peptide (AMP) အသစ်များကို ထုတ်လုပ်ပေးပါသည်။ ဤလုပ်ငန်းသည် ထုတ်လုပ်ထားသော peptide များ၏ ထူးခြားသော ဘက်တီးရီးယားပိုးသတ်ဆေးအာနိသင်များဖြင့် လူသိများသော တက်ကြွ/မလှုပ်ရှားသည့် peptide များ၏ analogues များကို ထိန်းချုပ်နိုင်သော ထုတ်လုပ်မှုအောင်မြင်သည့် ပထမဆုံးလုပ်ငန်းဖြစ်သည်။ ၎င်းသည် ကမ္ဘာလုံးဆိုင်ရာ အဏုဇီဝပိုးများ တိုက်ဖျက်နိုင်စွမ်း အကျပ်အတည်းကို ဖြေရှင်းရန် အစွမ်းထက်သော တွက်ချက်မှုဒီဇိုင်းကိရိယာတစ်ခုကို ပေးပါသည်။